1500年，大将军托马斯（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）奉皇后伊莎贝拉（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰）之命前往新大陆寻找创传说中的“生命之树”。只要饮下一滴树的汁液，便会获得永生。一路历尽千辛万苦，终于到达了一座辉煌的隐蔽之地，看到了永生难忘的奇异景象。2000年，脑癌专家汤米（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）急切为患脑癌的妻子丽兹（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰）寻找良药。研究小组从南美洲丛林里带回了一株奇异的树种标本，在提炼药物用于黑猩猩实验时奇迹般地产生了效果。2500年汤姆•乘坐着用思想控制的透明圆球飞船中，穿梭于太空宇宙。辽阔的星际间，身边却只有那棵已快死亡的古树，他无时无刻不回想着关于丽兹的记忆。千年的奔涌时空里，苦苦寻觅的一直是生命的真谛……
在奥克兰，三个孩子遭遇了奇异的彩虹，通过彩虹的能量波动穿越到了中国。因为他们的莽撞之举，造成了这个世界的能量失衡。在中国获得帮助的他们，最终克服了重重障碍让这个世界恢复了原有的模样，同时也获得了成长与友谊。
四名女学生沈迷于银仙游戏，可是在玩毕后，邪门之事接踵而来。其中阿May与晴相约打机，阿May玩跳舞机时突然不能自制，被神秘力量令她跳至脚肿才能停止，后来更在半梦半醒之间似觉被污辱多次。晴则在来机铺认识一男子，两人感情发展顺利，而晴问银仙有关她与男子的事，银仙均表示赞同。正当二人同往探望病愈的阿May 时，阿May见该男子后即表现得非常惊恐，而该男子亦终于展露出狰狞面孔……
哈利在德思礼的家里，焦急地等待校长的来访，邓布利多带他到一个神秘的地方，告诉他和哈瑞斯制服伏地魔的方aaa。在魔法学校，哈利、罗恩和赫敏继续着三人小组的学习；斯内普教授仍时不时找哈利的麻烦。r 在一次课上，哈利和赫敏无意中发现了一本奇书，书上每页都有混血王子详细的手写注释，繁重的功课让哈利没时间研究此书，但在关键时刻这本书总能带给他好运。r 圣诞节后，罗恩度过了一个并不愉快但却十分新奇的生日...
利亚姆是一位被时间束缚的科学研究者，随着他的时间跳跃变得更加极端，他被一位神秘老人引导到未来，在那里他目睹了他可能造成的世界末日。
正在调查坠落在太平洋上的不明飞行物体的海上自卫队二尉有动贵文（大澄贤也），遇到了突然出现的蓝光，受发光体的影响，导致遗传因子标准的变质，变成了凶恶的怪兽THE ONE。之后，他（THE ONE）从防卫厅内的特殊机关BCST（对生物工程学的研究机关）的监视下逃走，从此就没了音训。 另一方面，航空自卫队F15J飞行员真木舜一（别所哲也），为了多点时间陪伴患有先天性疾病的儿子继梦决定辞去官职。在最后一次飞行中真木与“红色发光体”在空中相遇。这是the one事件后3个月发生的事情。但是真木奇迹般地生还，然后转职成为了民航机飞行员，展开了新生活。对这样的真木还是有机关非常关注，尤其是BCST中的化学担当官水原沙罗，BCST将真木强制带走，在废工厂中搭建的BCST研究室进行身体上的监视。此时行踪不明的怪兽THE ONE像被某种东西吸引而回来了。遭受THE ONE攻击而濒死的真木，身体发生了变化，在红色光球的力量之下变身了！变成身高10M拥有银色光芒的钢铁身体型态，偶而还有自己意志的真木，跟THE ONE展开作战，但是因为变身不完全，能量快速消耗，在遭到决定性的一击后变回了真木舜一的型态。然后沙罗将这个在THE ONE之后出现的生命体定名为“THE NEXT”。 真木在从东京被护送回BCST研究室的途中得知了儿子继梦入院的消息,在赶到医院后跟妻子蓉子再次的碰面了。此时,人类最大的危机出现了,在吸收了各式各样的生物进入体内而产生变异的"THE ONE"重返出现在新宿的街道上,从口中发出的的超绝火炎光弹将街道烧毁殆尽有恸的人格已经被"THE ONE"取代,已经成为不能变回为人的状态。不过那样的有恸以前与水原沙罗却是有着婚约的情侣为了沙罗心中的回忆，并且为了跟儿子继梦的约定，为了保护心爱的家族，真木再次变身。那个姿态更加进化成巨大化40m，在间接部有像流血般的红色，两肘的特征是出现肘刀。现在，以新宿副市中心为舞台，ULTRAMAN与"THE ONE"的决战之火开始燃烧了！
异星球因为文明衰落，导致战争不断，客族大将异客率领部下准备推翻波伊夫人的统治，但无奈没有五行珠一时还攻陷不下，于是借来凤凰之力，准备给波伊夫人致命一击，就在异客将军快要攻陷波伊族皇宫时，波伊夫人将公主新月雅和新月冰送到地球，并把拥有无限力量的五行珠交予新月雅，期望她们能快速学习地球文明来复兴异星衰落的文明。
该片讲述了IF公司的研究基地在研发期间突然集体失联，项目负责人刘超带领科考小队深入地底矿脉进行调查，项目组田教授之子田力为寻找同样失联的女儿妞妞加入小队，一行人深入实验室发现项目组创造的改造蜂失控并袭击了实验室所有人，而营救妞妞的田力与队员也遭遇了一场惊心动魄的惊险之旅。
